本報訊 近日，中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所和安利植物研發(fā)中心宣布，利用納米孔測序技術(shù)突破復(fù)雜基因組測序，該團(tuán)隊在世界首次完成了菊屬植物菊花的全基因組測序，并完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉(zhuǎn)錄組遺傳信息發(fā)掘。相關(guān)研究成果和基因組數(shù)據(jù)已在中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所官網(wǎng)及安利植物研發(fā)中心學(xué)術(shù)研究網(wǎng)站公布，并向全世界研究菊花的學(xué)術(shù)團(tuán)隊和非營利組織免費開放。

菊屬植物染色體結(jié)構(gòu)復(fù)雜，包含從2n=18到8n=72之間的各種染色體組結(jié)構(gòu)。生產(chǎn)上作為菊花茶使用的菊花（以著名的杭白菊為例）是一個復(fù)雜的多倍體物種，由多套二倍體亞基組成。菊屬是一個非常大的植物分類單位，包括菊組和苞葉組兩大分支。面對菊花復(fù)雜的染色體遺傳結(jié)構(gòu)以及豐富的種質(zhì)資源多樣性，進(jìn)行菊花基因組測序?qū)τ诮沂揪諏傥锓N的起源進(jìn)化及物種多樣性具有重要意義。

聯(lián)合團(tuán)隊利用納米孔測序結(jié)合二代高通量測序技術(shù)，對分布于江蘇南京的野菊花品種進(jìn)行全基因測序、組裝、注釋及相關(guān)分析，共組裝出了約3Gb基因組總長，鑒定出了101745個編碼蛋白基因。通過比較研究發(fā)現(xiàn)，整個基因組中存在大量的重復(fù)序列，這可能是整個菊屬植物基因組較為復(fù)雜的原因。同時研究人員對多倍體菊花品種杭白菊進(jìn)行了全長轉(zhuǎn)錄組比較分析，闡明野菊花和杭白菊直接存在極大的遺傳上的親緣關(guān)系。